MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 24116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021911	AGA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021911	GCG	2	6	27	32	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021911	GTTC	2	8	40	47	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021911	CGGG	2	8	58	65	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021911	CGAC	2	8	148	155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021911	TGT	2	6	181	186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021911	ATA	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021911	CG	3	6	251	256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021911	CGT	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021911	GAAGG	2	10	323	332	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021911	CCGG	2	8	367	374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021911	CGC	2	6	422	427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021911	TCC	2	6	467	472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021911	CGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021911	TCAA	2	8	614	621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021911	CTT	2	6	663	668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021911	GCCG	2	8	688	695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021911	AT	3	6	705	710	50 %	50 %	0 %	0 %	528837522
19	NC_021911	CGA	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837522
20	NC_021911	GC	4	8	832	839	0 %	0 %	50 %	50 %	528837522
21	NC_021911	TCG	3	9	857	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
22	NC_021911	CGGCC	2	10	894	903	0 %	0 %	40 %	60 %	528837522
23	NC_021911	CG	3	6	923	928	0 %	0 %	50 %	50 %	528837522
24	NC_021911	GCC	2	6	943	948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837522
25	NC_021911	CGT	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
26	NC_021911	CGT	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
27	NC_021911	GA	3	6	1148	1153	50 %	0 %	50 %	0 %	528837522
28	NC_021911	CAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837522
29	NC_021911	GTC	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
30	NC_021911	TGG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837522
31	NC_021911	GTC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
32	NC_021911	GGA	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837522
33	NC_021911	GCG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837522
34	NC_021911	CGA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837522
35	NC_021911	GTC	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
36	NC_021911	ACG	2	6	1450	1455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837522
37	NC_021911	CGG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837522
38	NC_021911	GTCG	2	8	1482	1489	0 %	25 %	50 %	25 %	528837522
39	NC_021911	ACA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837522
40	NC_021911	CGC	2	6	1630	1635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837523
41	NC_021911	GGC	2	6	1656	1661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837523
42	NC_021911	GCT	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837523
43	NC_021911	CTG	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837523
44	NC_021911	ACC	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837523
45	NC_021911	ATG	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837523
46	NC_021911	CGT	3	9	1850	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837523
47	NC_021911	GGC	2	6	1959	1964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837523
48	NC_021911	GAG	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837523
49	NC_021911	GCA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837523
50	NC_021911	CGG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837523
51	NC_021911	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837523
52	NC_021911	CGT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837523
53	NC_021911	CG	4	8	2177	2184	0 %	0 %	50 %	50 %	528837523
54	NC_021911	CATCGG	2	12	2213	2224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528837523
55	NC_021911	CCG	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837523
56	NC_021911	ACG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837523
57	NC_021911	CTC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021911	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837524
59	NC_021911	CCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837524
60	NC_021911	CCT	2	6	2565	2570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837524
61	NC_021911	GCG	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837524
62	NC_021911	CGGG	2	8	2773	2780	0 %	0 %	75 %	25 %	528837524
63	NC_021911	AGC	4	12	2837	2848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837524
64	NC_021911	CGA	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837524
65	NC_021911	GCA	2	6	3093	3098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837524
66	NC_021911	TCG	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837524
67	NC_021911	GAT	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837524
68	NC_021911	CG	4	8	3153	3160	0 %	0 %	50 %	50 %	528837524
69	NC_021911	TCG	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837524
70	NC_021911	GC	3	6	3191	3196	0 %	0 %	50 %	50 %	528837524
71	NC_021911	CGG	2	6	3345	3350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837524
72	NC_021911	GCA	2	6	3435	3440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021911	ATT	2	6	3461	3466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021911	GA	3	6	3495	3500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021911	CAGA	2	8	3535	3542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021911	CAA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837525
77	NC_021911	CG	3	6	3620	3625	0 %	0 %	50 %	50 %	528837525
78	NC_021911	TGG	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837525
79	NC_021911	TTC	2	6	3671	3676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837525
80	NC_021911	AAG	2	6	3736	3741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
81	NC_021911	GAA	2	6	3759	3764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
82	NC_021911	TGA	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837525
83	NC_021911	TGG	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837525
84	NC_021911	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
85	NC_021911	GCG	3	9	3887	3895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
86	NC_021911	CAG	2	6	3907	3912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837525
87	NC_021911	CGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
88	NC_021911	CCG	2	6	3963	3968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
89	NC_021911	CGG	2	6	4083	4088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
90	NC_021911	CGA	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837525
91	NC_021911	GCG	2	6	4163	4168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
92	NC_021911	GC	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	528837525
93	NC_021911	ACG	2	6	4304	4309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837525
94	NC_021911	CGG	2	6	4332	4337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
95	NC_021911	GGC	2	6	4399	4404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
96	NC_021911	CCG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
97	NC_021911	ACT	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837525
98	NC_021911	CCGG	2	8	4570	4577	0 %	0 %	50 %	50 %	528837525
99	NC_021911	GGCG	2	8	4589	4596	0 %	0 %	75 %	25 %	528837525
100	NC_021911	GAA	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
101	NC_021911	CGATC	2	10	4686	4695	20 %	20 %	20 %	40 %	528837525
102	NC_021911	A	6	6	4700	4705	100 %	0 %	0 %	0 %	528837525
103	NC_021911	CGC	2	6	4711	4716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
104	NC_021911	CGTG	2	8	4756	4763	0 %	25 %	50 %	25 %	528837525
105	NC_021911	AC	3	6	4774	4779	50 %	0 %	0 %	50 %	528837525
106	NC_021911	CCG	2	6	4856	4861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
107	NC_021911	TCG	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837525
108	NC_021911	GCCTCG	2	12	4960	4971	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528837525
109	NC_021911	GCG	3	9	4994	5002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
110	NC_021911	GC	4	8	5009	5016	0 %	0 %	50 %	50 %	528837525
111	NC_021911	CGC	2	6	5112	5117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
112	NC_021911	AAG	2	6	5131	5136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
113	NC_021911	TCGC	2	8	5140	5147	0 %	25 %	25 %	50 %	528837525
114	NC_021911	GCC	2	6	5170	5175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
115	NC_021911	GGC	3	9	5187	5195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
116	NC_021911	CGG	2	6	5199	5204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
117	NC_021911	CATT	2	8	5269	5276	25 %	50 %	0 %	25 %	528837525
118	NC_021911	CGC	2	6	5279	5284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
119	NC_021911	GAA	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
120	NC_021911	TCG	2	6	5360	5365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837525
121	NC_021911	TCG	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837525
122	NC_021911	ACGA	2	8	5485	5492	50 %	0 %	25 %	25 %	528837525
123	NC_021911	CTT	2	6	5493	5498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837525
124	NC_021911	GCC	2	6	5536	5541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
125	NC_021911	AAGG	2	8	5545	5552	50 %	0 %	50 %	0 %	528837525
126	NC_021911	CTCGCA	2	12	5625	5636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528837525
127	NC_021911	GC	3	6	5640	5645	0 %	0 %	50 %	50 %	528837525
128	NC_021911	TCG	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837525
129	NC_021911	CGA	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021911	TCC	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_021911	GCG	2	6	5862	5867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021911	GAG	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021911	TC	3	6	5934	5939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021911	GCA	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021911	CGAC	2	8	6012	6019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021911	GGA	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021911	ATTGG	2	10	6112	6121	20 %	40 %	40 %	0 %	528837526
138	NC_021911	ATC	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837526
139	NC_021911	GCG	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837526
140	NC_021911	CGT	2	6	6156	6161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837526
141	NC_021911	GAT	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837526
142	NC_021911	GGC	2	6	6180	6185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837526
143	NC_021911	CGGC	2	8	6201	6208	0 %	0 %	50 %	50 %	528837526
144	NC_021911	GGTC	2	8	6291	6298	0 %	25 %	50 %	25 %	528837526
145	NC_021911	CGG	2	6	6336	6341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837526
146	NC_021911	TGG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837526
147	NC_021911	TGAACG	2	12	6389	6400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528837526
148	NC_021911	ATC	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837526
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150	NC_021911	CAG	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837526
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152	NC_021911	GGA	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837526
153	NC_021911	GGCG	2	8	6669	6676	0 %	0 %	75 %	25 %	528837526
154	NC_021911	GAA	2	6	6913	6918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021911	CGC	2	6	6929	6934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_021911	CT	3	6	6940	6945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_021911	GCC	2	6	6956	6961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_021911	GCG	2	6	6965	6970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_021911	ACG	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021911	CAA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_021911	CAG	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837527
162	NC_021911	ATC	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837527
163	NC_021911	GTCGCC	2	12	7128	7139	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528837527
164	NC_021911	GAA	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837527
165	NC_021911	GGCCG	2	10	7222	7231	0 %	0 %	60 %	40 %	528837527
166	NC_021911	GC	3	6	7234	7239	0 %	0 %	50 %	50 %	528837527
167	NC_021911	TC	3	6	7265	7270	0 %	50 %	0 %	50 %	528837527
168	NC_021911	GGAGG	2	10	7317	7326	20 %	0 %	80 %	0 %	528837527
169	NC_021911	TCA	2	6	7434	7439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837527
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171	NC_021911	TCA	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837527
172	NC_021911	CCG	2	6	7712	7717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837528
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174	NC_021911	CGG	2	6	7764	7769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837528
175	NC_021911	CGG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837528
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177	NC_021911	TCATG	2	10	7872	7881	20 %	40 %	20 %	20 %	528837528
178	NC_021911	AAC	2	6	7887	7892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_021911	CTG	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837529
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181	NC_021911	TCG	2	6	8063	8068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837529
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187	NC_021911	CGG	2	6	8491	8496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_021911	GCC	2	6	8522	8527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837530
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262	NC_021911	GC	3	6	11557	11562	0 %	0 %	50 %	50 %	528837533
263	NC_021911	CAG	2	6	11563	11568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837533
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266	NC_021911	CGA	2	6	11622	11627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837533
267	NC_021911	CGGC	2	8	11634	11641	0 %	0 %	50 %	50 %	528837533
268	NC_021911	TTGCAT	2	12	11668	11679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	528837533
269	NC_021911	CA	3	6	11684	11689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
270	NC_021911	GAC	2	6	11736	11741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837534
271	NC_021911	GACATC	2	12	11775	11786	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528837534
272	NC_021911	ATT	2	6	11818	11823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528837534
273	NC_021911	GTC	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837534
274	NC_021911	AAG	2	6	11910	11915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837534
275	NC_021911	GAT	2	6	11949	11954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837534
276	NC_021911	TCG	2	6	11956	11961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837534
277	NC_021911	AAGGTC	2	12	11967	11978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528837534
278	NC_021911	GGC	2	6	12054	12059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837534
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281	NC_021911	CTT	2	6	12164	12169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837535
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284	NC_021911	GCC	2	6	12380	12385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837535
285	NC_021911	ATG	2	6	12422	12427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837535
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297	NC_021911	CGG	2	6	13078	13083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837535
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303	NC_021911	TGC	2	6	13311	13316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837535
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359	NC_021911	CAT	2	6	15795	15800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
360	NC_021911	GCA	2	6	15815	15820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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381	NC_021911	GA	3	6	16688	16693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
382	NC_021911	CGG	2	6	16750	16755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_021911	GTG	2	6	16764	16769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_021911	CGA	2	6	17478	17483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837539
398	NC_021911	GAC	2	6	17594	17599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837539
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401	NC_021911	CGG	3	9	17705	17713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837540
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474	NC_021911	GAGGG	2	10	20714	20723	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
475	NC_021911	GCAA	2	8	20778	20785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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479	NC_021911	CGA	2	6	20995	21000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
480	NC_021911	CAC	2	6	21072	21077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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484	NC_021911	GGA	2	6	21197	21202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
485	NC_021911	CG	5	10	21356	21365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_021911	GCGA	2	8	21412	21419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_021911	ATC	2	6	21525	21530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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495	NC_021911	CG	3	6	21738	21743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_021911	GC	3	6	21805	21810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_021911	TCG	2	6	21815	21820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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